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为快而生”丨华为联手中科大铸就高校超算新标杆

2020-07-28 09:44:51   作者:   来源:CTI论坛   评论:0  点击:


  “小科小科,吃饭去啊。”
  “你们先去吧,等会人少了我再去。最近事太多,我要抓紧把这组数据跑个结果出来,导师催着要呢。”
  “你还在用咱们实验室的集群在跑吗?”
  “是啊,实验室买了这么多服务器,可还是跑的很慢。”
  “你去超算中心啊,他那边跑的快很多。”
  “我之前试过,那边排队太长了,比我们实验室快不了多少。”
  “现在他们新买的华为HPC平台,规模比之前大了很多,作业周转快基本不用排队。而且I/O特别快,算我们这种作业快得不要不要的。”
  “真的吗?那我赶紧试试华为的平台。”
  小科登录超算中心的系统,提交了几个计算作业。不用不知道,一用就见识了这个平台的快:下午提交的作业到凌晨依次运行完毕,第二天一早就拿到了需要的计算结果。
  “幸亏你推荐我去超算中心跑程序,不然用实验室的集群估计还要跑10天半个月。”
  瀚海助力科大超算集群表现亮眼
  帮助小科的这个平台叫做“瀚海20超级计算系统”,他拥有CPU计算集群30480颗核,系统理论峰值性能2.52Pflops,实测HPL双精度浮点计算能力:700个节点1.43PFlops,计算效率为63.95%,甚至部分计算节点HPL效率跑出了71%以上的超高性能。“瀚海20系统”采用InfiniBand HDR100 100Gbps网络技术构建的全线速的高速计算网络,在600纳秒的极低延迟下,每秒可发送2亿条消息,让用户获得更快的网络性能,也是全国高校首例。
  瀚海20系统单节点HPL性能统计
  中科大瀚海20系统负载
  不光是小科同学,中科大合肥微尺度物质科学国家研究中心的胡老师针对大尺度分子固体材料的第一性原理计算模拟,以自主开发的第一性原理线性标度计算软件DGDFT[JCP 143, 124110 (2015)]为基础,开发低标度、低通讯,低内存、低访存的并行计算方法,实现超大规模高性能并行计算,其中DGDFT采用了多级MPI并行以及高效求本征值方法,具有高度可扩展性。而本次测试在某校外超算和“瀚海20系统”超算平台上分别计算金属石墨烯C2880(2880个碳原子),在相同核数下的绝对计算速度比该校外超算运行快30%以上。
  DGDFT软件在校外某超算和“瀚海20”超算系统上测试金属石墨烯C2880计算的并行
  瀚海为用户提供多种选择
  “瀚海20系统”还为科研用户提供了多种计算选择,其采用20台华为Taishan服务器构建的鲲鹏生态计算集群,其中的华为Taishan服务器采用鲲鹏架构,该架构芯片在部分单精度和整型计算应用程序性能表现优异,可用于生物信息学计算软件,和流体力学计算。中国科大网络信息中心张焕杰老师就利用其实现了ARM平台甄别邮件系统中用户弱口令问题,由原来的需要1天,缩短到30几秒即可完成,大大缩短了处理时间,提高了邮件系统的安全性。
  瀚海超算集群节能环保
  中科大“瀚海20系统”不只性能强,而且更加绿色环保,系统采用液冷技术进行高效散热,可循环使用的冷却水流经CPU、内存等高发热量器件,80%的热量直接由冷却水带走,大幅降低超算中心的散热能耗。其中的720台华为X6000液冷高密服务器计算节点仅需10个机柜即可部署,每个机柜72个节点39KW的超高密计算系统,相比传统服务器每年至少可节省电费17余万元。
  中科大“瀚海20系统”

  中科大“瀚海20系统”液冷计算节点
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